DNA甲基化是空想的标记物
2018年2月《NATURE REVIEWS CLINICAL ONCOLOGY》揭橥了题为“Epigenome-based cancer risk prediction: rationale, opportunities and challenges”的综述,指出基于表不雅观遗传,特殊是DNA甲基化的检测,能够知足肿瘤风险预测的各项需求,为肿瘤风险筛查和预防供应了新的机遇:
DNA甲基化检测能够综合反响遗传和非遗传成分的风险效应;

DNA甲基化具有生物学稳定性,可以采取组学方法检测,技能稳定可重复;
DNA甲基化可以在随意马虎获取的生物样本中检测到,并建立风险预测模型(risk-prediction score),提示风险成分或者疾病发展状态;
DNA甲基化可用于监控肿瘤风险掌握方法的效果。
基于DNA甲基化标记预测肿瘤风险的研究汇总
DNA甲基化课题研究策略
DNA甲基化技能选择
Illumina Infinium MethylationEPIC BeadChip(简称850K 甲基化芯片)
Illumina的甲基化芯片Infinium Methylation EPIC BeadChip(简称850k芯片),供应了性能优胜且经济可靠的甲基化办理方案。850K芯片是在原450K芯片巨大成功的根本上,推出的新一代DNA甲基化芯片。该芯片既包含原450K芯片91%的位点,又增加了413,745个位点(统共853,307个CpG位点)。850K芯片全面覆盖基因启动子区、基因编码区、CpG岛以及ENCODE及FANTOM5操持中创造的增强子区。
850K甲基化芯片既是肿瘤和其他繁芜疾病研究的有力工具,也是目前最适宜表不雅观全基因组关联剖析(EWAS)研究的DNA甲基化研究技能。
全面的基因组覆盖范围:检测>853,000个CpG位点,全面覆盖CpG岛、启动子、编码区、开放染色质和增强子。此外还包括CpG岛外的CpG位点,已知DMR位点,脱氧核糖核酸酶超敏位点以及miRNA启动子区域;
高质量的数据:同时采取Infinium I及II探针设计,使检测范围最大化;
分辨率高:单碱基分辨率,可以直接检测到发生甲基化的确切位点;
重复性高:自身技能重复干系性R2> 0.98;与450K交集探针间(850K vs 450K)干系性R2> 0.98;
起始模板量低:仅需 250 ng,大大节约了样品量;
检测样本类型更广:不仅可以检测全血、细胞、新鲜/新鲜冷冻的组织、而且也可检测FFPE样本。
850K芯片与WGBS参数比拟
中科普瑞850K 甲基化芯片剖析做事
中科普瑞850K 甲基化芯片剖析展示
中科普瑞850K 甲基化芯片剖析做事近期将升级到V2.0版本
敬请期待!
公司简介
中科普瑞,旗下拥有上海鲸舟医学考验实验室有限公司和上海鲸舟基因科技有限公司,立足新一代测序及其衍生技能,以医学生物信息学为核心,供应覆盖肿瘤等重大疾病风险评估,早期筛查,分子病理诊断,肿瘤精准用药辅导和预后预测等符合临床需求的办理方案,为精准医疗打造全方位做事平台,公司的中长期发展策略为医学大数据挖掘和人工智能的临床运用。
公司是十万人甲基化组操持(表不雅观星图操持)项目履行方,拥有专业的多组学技能做事团队,成熟的团队和技能平台供应基因组,转录组、表不雅观基因组,代谢组等多组学的实验剖析和生信剖析,以及多维度因果关联剖析,为广大医学和生物学研究职员供应专业的一站式做事。
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